Laboratorium Perum Jasa Tirta II merupakan laboratorium yang melayani pemantauan dan pengujian kualitas air dan lingkungan untuk internal dan eksternal Jasa Tirta II, seperti industri, domestik maupun rumah sakit.
Laboratorium Perum Jasa Tirta II adalah Laboratorium pengujian lingkungan yang telah terakreditasi ISO/IEC 17025 sejak tahun 2003 oleh Komite Akreditasi Nasional (KAN) dengan nomor akreditasi LP-174-IDN dan telah teregister pada Kementerian Lingkungan Hidup dan Kehutanan (KLHK) sebagai Laboratorium Lingkungan dengan nomor 00108/LPJ/Lablingk-1/LRK/KLH sejak tahun 2016.
Saat ini. Laboratorium Lingkungan Perum Jasa Tirta II telah menerapkan versi termutakhir ISO/IEC 17025:2017 dengan ruang lingkup parameter akreditasi sebanyak 114 parameter meliputi, parameter kimia, fisika dan mikrobiologi dari 9 komoditi produk yaitu air limbah, air permukaan (sungai/danau), air untuk keperluan hygiene sanitasi, air minum, udara ambien, emisi sumber tidak bergerak, kebisingan lingkungan, kebisingan lingkungan kerja dan Sampling, serta memiliki quality assurance proficiency test dari Era Water Company Canada.
Laboratorium Lingkungan Perum Jasa Tirta II juga memiliki tenaga kerja professional yang telah tersertifikasi BSNP.